앙코르 설정(setup)을 누르고 미디설정(midi-setup)에서 싱크보냄(sync) 두개모두 체크하고
녹음설정(record setup)의 모든 체크표를 지워버리시면 됩니다.
그리고 박자맞추는 메트로놈 소리는 설정(setup) 의 메트로놈 click on 의 체크표시를 지우시면 됩니다.
이 모든 환경을 바꾸셨으면 반드시 변경시킨 환경을  
설정 > 설정 저장 (setup - save preferences)를 클릭하여 저장시키십시오.

위 그림 처럼 미디 설정, 녹음 설정, 설정 저장 ... 잘 하셨는지요?
저는 WIN7에 앙코르4.5.5 설치해서 위 설정데로 하니 이상없이 작동합니다.
다른 Windows에서는 확인이 어려워 도움 드리기는 힘듭니다.

WIN7에서 위 그림처럼 설정해도 문제가 해결이 안된다면 ...
다시 설치해 보시기를 권장 드립니다. 해결되시면 꼭 알려주세요.

부디 잘 해결되시길...!!!